Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Sft2d1Q5SSN7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sft2d1Q5SSN7 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms