Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Ccdc88aQ5SNZ0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc88aQ5SNZ0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms