Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Trappc1Q5NCF2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Trappc1Q5NCF2 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Trappc1Q5NCF2 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
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Trappc1Q5NCF2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Trappc1Q5NCF2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Trappc1Q5NCF2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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