Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf38aQ4FK66 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf38aQ4FK66 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms