Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Shank3Q4ACU6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Shank3Q4ACU6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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