Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
H2al1nQ497L1 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
H2al1nQ497L1 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms