Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ulk4Q3V129 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms