Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Usp48Q3V0C5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp48Q3V0C5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Usp48Q3V0C5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Usp48Q3V0C5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Usp48Q3V0C5 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp48Q3V0C5 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp48Q3V0C5 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp48Q3V0C5 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Usp48Q3V0C5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Usp48Q3V0C5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp48Q3V0C5 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp48Q3V0C5 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp48Q3V0C5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp48Q3V0C5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp48Q3V0C5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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Usp48Q3V0C5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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