Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm44Q3V089 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms