Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmed1Q3V009 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmed1Q3V009 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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