Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rnpc3Q3UZ01 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms