Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm28047Q3US59 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms