Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
E130208F15RikQ3UPV3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms