Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccdc33Q3ULW6 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc33Q3ULW6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc33Q3ULW6 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc33Q3ULW6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc33Q3ULW6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc33Q3ULW6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc33Q3ULW6 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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