Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp19Q3UJD6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp19Q3UJD6 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms