Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trafd1Q3UDK1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trafd1Q3UDK1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms