Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf180Q3U827 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms