Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtpbp6Q3U6U5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12664-201ENSMUST00000118306 913 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42698-201ENSMUST00000197790 762 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtpbp6Q3U6U5 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.5 ms