Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc9Q3U0M1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc9Q3U0M1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms