Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Shcbp1lQ3TTP0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms