Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms