Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms