Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cpne9Q1RLL3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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