Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cers3Q1A3B0 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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