Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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ptchd1Q14B62 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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ptchd1Q14B62 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ptchd1Q14B62 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ptchd1Q14B62 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ptchd1Q14B62 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ptchd1Q14B62 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ptchd1Q14B62 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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ptchd1Q14B62 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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ptchd1Q14B62 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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ptchd1Q14B62 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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ptchd1Q14B62 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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ptchd1Q14B62 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ptchd1Q14B62 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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