Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rpusd2Q149F1 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rpusd2Q149F1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rpusd2Q149F1 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rpusd2Q149F1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpusd2Q149F1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rpusd2Q149F1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rpusd2Q149F1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpusd2Q149F1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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