Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc162pQ0VG85 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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