Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Vps8Q0P5W1 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms