Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spata18Q0P557 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms