Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms