Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms