Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700061G19RikQ08EE8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700061G19RikQ08EE8 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700061G19RikQ08EE8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700061G19RikQ08EE8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700061G19RikQ08EE8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700061G19RikQ08EE8 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700061G19RikQ08EE8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
1700061G19RikQ08EE8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700061G19RikQ08EE8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700061G19RikQ08EE8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700061G19RikQ08EE8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700061G19RikQ08EE8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700061G19RikQ08EE8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700061G19RikQ08EE8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700061G19RikQ08EE8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
1700061G19RikQ08EE8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
1700061G19RikQ08EE8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms