Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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Cnn1Q08091 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
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Cnn1Q08091 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cnn1Q08091 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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