Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
NrepQ07475 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
NrepQ07475 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms