Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm35135-201ENSMUST00000219885 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox12Q04890 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms