Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl7Q03366 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccl7Q03366 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms