Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Msx2Q03358 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms