Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1sQ02789 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms