Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GscQ02591 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GscQ02591 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
GscQ02591 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GscQ02591 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GscQ02591 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GscQ02591 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GscQ02591 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GscQ02591 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GscQ02591 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GscQ02591 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GscQ02591 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GscQ02591 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GscQ02591 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GscQ02591 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GscQ02591 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GscQ02591 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GscQ02591 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GscQ02591 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GscQ02591 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GscQ02591 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GscQ02591 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
GscQ02591 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GscQ02591 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GscQ02591 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GscQ02591 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
GscQ02591 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
GscQ02591 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GscQ02591 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
GscQ02591 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GscQ02591 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GscQ02591 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GscQ02591 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GscQ02591 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GscQ02591 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GscQ02591 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
GscQ02591 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GscQ02591 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GscQ02591 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GscQ02591 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
GscQ02591 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GscQ02591 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GscQ02591 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
GscQ02591 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
GscQ02591 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms