Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snai1Q02085 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snai1Q02085 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms