Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Hoxd1Q01822 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms