Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms