Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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HmgcrQ01237 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HmgcrQ01237 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HmgcrQ01237 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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HmgcrQ01237 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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HmgcrQ01237 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HmgcrQ01237 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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HmgcrQ01237 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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