Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SeleQ00690 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SeleQ00690 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms