Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GabpaQ00422 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GabpaQ00422 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GabpaQ00422 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms