Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rps3aP97351 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rps3aP97351 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms