Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms