Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Mesp1P97309 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Mesp1P97309 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Mesp1P97309 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Mesp1P97309 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Mesp1P97309 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Mesp1P97309 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Mesp1P97309 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Mesp1P97309 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Mesp1P97309 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Mesp1P97309 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Mesp1P97309 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mesp1P97309 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms