Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms