Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfixP70257 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfixP70257 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfixP70257 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfixP70257 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfixP70257 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfixP70257 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfixP70257 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfixP70257 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfixP70257 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfixP70257 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfixP70257 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfixP70257 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfixP70257 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfixP70257 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfixP70257 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NfixP70257 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfixP70257 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NfixP70257 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NfixP70257 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfixP70257 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfixP70257 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfixP70257 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfixP70257 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfixP70257 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfixP70257 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfixP70257 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfixP70257 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NfixP70257 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NfixP70257 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfixP70257 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfixP70257 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfixP70257 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfixP70257 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfixP70257 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfixP70257 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NfixP70257 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfixP70257 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfixP70257 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NfixP70257 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfixP70257 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NfixP70257 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfixP70257 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NfixP70257 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfixP70257 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfixP70257 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfixP70257 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfixP70257 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfixP70257 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfixP70257 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfixP70257 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfixP70257 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfixP70257 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfixP70257 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfixP70257 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NfixP70257 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfixP70257 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NfixP70257 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms